校史沿革
民國四十五年春，教育部訂頒國校畢業生免試升學方案，選定新竹縣為試辦地區，同年四月十七日，台灣省政府胡核准新竹縣政府試辦免試升學計畫，本校即係依據該方案於是年九月成立，定名為：「新竹縣立北埔初級中學峨眉分校」。
草創之初，篳路藍縷，校址無著，幾番措商，始遵照政府指示，暫借峨眉國民中學教室二間，接受峨眉鄉內各國校畢業生七十四名直升本校，分為兩班，於九月十七日正式上課。
四十七年秋，新建教室四間落成，是年冬正式遷入新校舍上課，同年並建有圖書室一間，教室職員宿舍三間，於是略具規模。
五十六年二月十七日正式奉准獨立設校，正名為「新竹縣立峨眉初級中學」，並派謝維嶽為首任校長。
五十七年秋政府實施延長國民教育為九年，此乃我國教育史上之新紀元，本校即易名為：「新竹縣立峨眉國民中學」。
六十二年八月教育廳以 范秉肇 先生接任本校，校務更蒸蒸日上。
六十五年十月奉准進行籌畫遷校事宜，並於當年秋天開工，迄民國六十九年九月遷校完成。
七十二年九月 姜萃香 女士接任本校，在既有的基礎上大力整頓，美化校園，加強學生生活教育等，成效卓著。
七十三年八月一日姜校長獲准退休，由教務處曾主任兼代校長。至七十四年三月二十五日教育廳派 楊木蘭 先生接任本校。校長到任後力求人事安定，並推行教學正常化，使本校校務之進展，邁向另一新的里程。
七十七年八月三十一日 黃瑞寶 先生接任本校不斷地充實硬、軟體設備，秉持「有教無類，因材施教」的原則，使得本校的教育更加落實。
八十一年三月二十七教育廳派 曾其文 先生接任本校，在既有的基礎上不斷地求進步，相信峨中的校務明日會更好。八十二年九月附設補校。
八十三年九月一日教育廳派倪靜貴校長接任本校，以人性化的領導，塑造良好的人文教育環境，全校師生氣氛融洽，校務欣欣向榮。
八十五年八月一日由教導主任彭紹彩代理校長，在現有的基礎下不斷地加強綠化美化工作，落實校園公園化，發揮境教之功能，平日注重學生生活教育、道德教育、民主法治教育，使「五育」獲得更均勻健全的發展。
八十七年八月一日劉文龍校長奉派接任本校，以「傳承與創新」為基本精神，以「學生第一，教學第一」、「帶好每一位學生」為辦校理念，兼重正式與潛在課程培養高品質、高品德，高品味的二十一世紀公民為主要目標。
九十年八月一日張華堂 先生接任本校第九任校長，積極推動「教育新創新，發展多元智能」，並以，「人文、專業、多元、民主、鄉土」為辦學理念。
九十二年八月一日許世烈 先生接任本校第十任校長，以培育二十一世紀優秀公民帶好每一位學生為主要目標，讓本校學生「和樂生活、健康成長、全方為學習」。
九十六年八月一日陳淑媯校長接任本校第十一任校長，積極推動鄉土語言教學，落實教學專業，推動校務工作為首務，行政支援教學，學生學習為最優先考量，並以「陶冶學生健全人格，以為日後社會之中堅」為理念。
九十七年八月一日曾美玲校長奉調接任，致力於加強學生生活教育，培育藝文素養，提升閱讀風氣，語文教育等，期盼峨眉國中邁向更優質之教育願景。
一百零一年八月一日陳姿利校長奉調接任，認為學校教育的主體是學生，秉持「學生第一，教學至上」的原則，努力啟發學生潛能，讓每位孩子健康成長、快樂學習、多元發展、具備創新能力，得以應付未來生活之挑戰。
陳姿利校長看見孩子對未來不抱期待的困境，思考如何把在地的文化底蘊發展成為教學的核心，透過認識家鄉文化，發現自己文化的獨特性，進而以家鄉文化為榮，從根建立學生的自信。經過學校與鄉內人士共同激盪之下，「書香。茶香。峨眉飄香」成為學校發展的願景。
一百零四年本校以「茶香‧茶鄉‧峨眉飄香」獲得營造空間美學與發展特色學校計畫佳作。
一百零五年105-106學年度連續兩年入選推動偏鄉國中小學特色遊學競爭型計畫校友彩繪圍牆留念。
一百零六年在茶香這個願景下，透過鄉公所和社區共同努力發展「踏茶尋眉」課程，課程除了讓孩子理解茶鄉文化的珍貴並為此產生尊榮感之外，峨眉國中榮獲106年教學卓越金質獎。
八月一日，在書香這個願景下，與陳超明教授團隊合作開始推動雙語教學來豐厚學生的羽翼，其背後最大的圖像是「有朝一日孩子站在國際舞台上用英語介紹自己獨一無二的家鄉文化」。
同年以「每個孩子都是上天的精心傑作，用對方法，就會發光發亮」教育理念榮獲親子天下教育創新領袖表彰。
一百零七年八月一日，獲准辦理學校型態實驗教育（新竹縣第一所公辦公營實驗教育國中）。
一百零八年八月一日，轉型公辦民營KIST學校（竹苗區第一所公辦民營實驗教育國中）。
一百一十二年以「品格實踐於生活,學習掌控在自我，以在地優勢文化，點燃學習熱情，全校力量陪伴孩子成長，涵育生命續航力。」的學校經營理念，榮獲親子天下教育創新100。
一百一十三年啟動峨眉十年教育夢，誠致教育基金全力支持學校從校園走到社區，期望學校透過鄉公所和社區再一次的努力，不只用全鄉的力量呵護峨眉鄉未來的人才，同時打造一條在峨眉發展與創造幸福生活的路。七月六日，首創峨眉地方學成果展，峨眉鄉三校結合社區聯合辦理「共下」來丹桂宮，「學玩」峨眉鄉，串聯峨眉鄉親，建立峨眉地方學的共識，並提供學生展能舞台，以及行銷峨眉鄉教育品牌 。
一百一十四年一月十日，由峨眉國中、峨眉國小、富興國小、寶山國小攜手社區共同舉辦的「共下來赤柯坪 — 學玩峨眉竹49」，四所學校與在地社區單位合作，帶領參與者深度探索峨眉風光與文化，體驗鄉土風情。七月十七日，結合隆聖宮九獻禮辦理第二屆峨眉鄉地方學成果展：「共下」來隆聖宮，「學玩」富興村，建構學校與社區協作模式(全鄉共教)，積極發展人文地景產探索的共學之鄉，打造峨眉風土旅程品牌(地方學) 。